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Se puede obtener un thread-dump mandando una señal con kill al proceso. De la siguiente manera:

kill -3 <PID>

Y en el log del jboss o tomcat saldra el thread-dump.

Otra manera es usar herramientas que proporciona la JDK como jstack:

jstack <PID>

Muy util si hay un problema de CPU y es imposible poder entrar por el jmx-console.

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