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Despues de buscar soluciones raras la mas sencilla que he encontrado es esta:

mkdir /tmp/mergepatchs

cd ~/repo1

mkdir repo1

mv !(repo1) repo1

git commit -a -m “Preparando el proyecto para ser movido a otro repo”

git format-patch -o /tmp/mergepatchs –root

cd ~/repo2

git am /tmp/mergepatchs/*.patch

Despues de esto tendremos dentro de “~/repo2” una carpeta “repo1” con todo lo que habia en el repo1 y con toda su historia.

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